MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella baltica OS185 plasmid pS18501

Total Repeats: 287

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009661	CCAA	2	8	1389	1396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009661	GTT	2	6	1404	1409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009661	CCAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009661	GAT	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009661	TAA	2	6	1464	1469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009661	T	6	6	1537	1542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009661	TTG	2	6	1550	1555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009661	T	7	7	1557	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009661	AGA	2	6	1573	1578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009661	CTAA	2	8	1653	1660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009661	TAC	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009661	GCTT	2	8	1757	1764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_009661	TTG	2	6	1796	1801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009661	ATT	2	6	1870	1875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009661	AGTT	2	8	1910	1917	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009661	ACTG	2	8	1950	1957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009661	ATCAAT	2	12	1971	1982	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_009661	CTTTA	2	10	2051	2060	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_009661	TTA	2	6	2081	2086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009661	A	6	6	2150	2155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009661	ATT	2	6	2207	2212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009661	GTAA	2	8	2959	2966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009661	ATTT	2	8	2993	3000	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009661	CTTC	2	8	3142	3149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009661	T	7	7	3159	3165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009661	AT	3	6	3881	3886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009661	TTG	2	6	3994	3999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009661	ATT	2	6	4384	4389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009661	GAAG	2	8	4406	4413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009661	GTTTGA	2	12	4419	4430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009661	TCC	2	6	4454	4459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009661	TGG	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009661	A	6	6	4561	4566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009661	ATG	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009661	GCGG	2	8	4613	4620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009661	CAT	2	6	4629	4634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009661	TAT	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009661	TTA	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009661	CTG	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009661	TGC	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009661	GCA	2	6	4743	4748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009661	GGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009661	ACCGT	2	10	4908	4917	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_009661	TCC	2	6	4927	4932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_009661	ATT	2	6	6062	6067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009661	GTTG	2	8	6138	6145	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009661	GTA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009661	TAA	2	6	6249	6254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009661	ATGC	2	8	6286	6293	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_009661	AAAGA	2	10	6367	6376	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009661	ATT	2	6	6537	6542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009661	GCC	2	6	6705	6710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009661	TTC	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009661	GAT	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009661	AAT	2	6	7350	7355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009661	AAT	2	6	10080	10085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009661	A	6	6	10088	10093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009661	TA	3	6	10104	10109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009661	GATA	2	8	10149	10156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009661	ATA	2	6	10317	10322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009661	T	6	6	10507	10512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009661	TCAA	2	8	10593	10600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_009661	AAT	2	6	10666	10671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009661	TG	3	6	11359	11364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009661	GGC	2	6	11740	11745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009661	CGC	2	6	11748	11753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009661	CCCA	2	8	11889	11896	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_009661	A	6	6	11922	11927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009661	A	6	6	11938	11943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009661	A	8	8	12609	12616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009661	GGAA	2	8	12625	12632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009661	ATG	2	6	13696	13701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009661	TTG	2	6	13794	13799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009661	GTGAT	2	10	13806	13815	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009661	TAT	2	6	13842	13847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009661	TGA	2	6	14951	14956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009661	CAT	2	6	15044	15049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009661	AT	3	6	15081	15086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009661	AT	3	6	15133	15138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009661	TAA	2	6	16345	16350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009661	GAT	2	6	17548	17553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009661	AGA	2	6	17737	17742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009661	GTT	2	6	17899	17904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009661	CGG	2	6	17918	17923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_009661	TTA	2	6	17930	17935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009661	T	6	6	18923	18928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009661	A	6	6	18952	18957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009661	A	6	6	18971	18976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009661	TTAG	2	8	20988	20995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009661	ATT	2	6	21062	21067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009661	CAT	2	6	21175	21180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009661	GAA	2	6	21313	21318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009661	GAG	2	6	21335	21340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009661	A	6	6	21355	21360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009661	CT	3	6	21369	21374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009661	AAAAG	2	10	21490	21499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009661	AGTGA	2	10	21532	21541	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_009661	ATA	2	6	21666	21671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009661	AGA	2	6	21696	21701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009661	CTG	2	6	21708	21713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009661	TGT	2	6	22579	22584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009661	ATAAA	2	10	22590	22599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009661	CT	3	6	22632	22637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009661	A	6	6	23607	23612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009661	C	6	6	23622	23627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_009661	GGT	2	6	23751	23756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009661	AT	3	6	24408	24413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009661	ACC	2	6	24869	24874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009661	ATT	2	6	25139	25144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009661	CAG	2	6	25196	25201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009661	TTA	2	6	25218	25223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009661	ATA	2	6	25253	25258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009661	GGT	2	6	25447	25452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009661	TCG	2	6	26167	26172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009661	GGC	2	6	26177	26182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009661	CTA	2	6	26199	26204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_009661	ATGCT	2	10	26211	26220	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009661	A	6	6	26267	26272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009661	AT	3	6	26358	26363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009661	TTC	2	6	26992	26997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009661	ACTC	2	8	27133	27140	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009661	GTC	2	6	27163	27168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009661	GCTG	2	8	27207	27214	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009661	GTT	2	6	27222	27227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009661	CAA	2	6	27272	27277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009661	AAT	2	6	27284	27289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009661	CAA	2	6	27314	27319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009661	ATT	2	6	27335	27340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009661	T	6	6	27402	27407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009661	GCG	2	6	27429	27434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009661	A	6	6	27446	27451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009661	GCA	2	6	27463	27468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009661	ATTTTT	2	12	27484	27495	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009661	T	7	7	27491	27497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009661	ATT	2	6	27514	27519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009661	ATGCA	2	10	27553	27562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_009661	CTG	2	6	27591	27596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009661	TTG	2	6	27636	27641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009661	TA	3	6	27700	27705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009661	GTG	2	6	28999	29004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009661	CGT	2	6	29050	29055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_009661	AT	3	6	30512	30517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009661	CAC	2	6	30553	30558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_009661	GAA	2	6	30626	30631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009661	TTGT	2	8	30664	30671	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009661	GT	3	6	30677	30682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009661	AAGA	2	8	30704	30711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009661	TCAT	2	8	30719	30726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_009661	TG	3	6	30776	30781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009661	A	6	6	30785	30790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009661	ATG	2	6	30842	30847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009661	GTTT	2	8	30967	30974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009661	TCGG	2	8	31969	31976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_009661	TCGCT	2	10	31982	31991	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
155	NC_009661	GCAA	2	8	32018	32025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_009661	CAA	2	6	32067	32072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_009661	CCAAA	2	10	32079	32088	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
158	NC_009661	CTT	2	6	32208	32213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_009661	CGC	2	6	32253	32258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_009661	GC	3	6	32260	32265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_009661	TGTC	2	8	32269	32276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_009661	TAAA	2	8	34285	34292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009661	TG	3	6	34299	34304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009661	GT	3	6	34310	34315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009661	ATA	2	6	34316	34321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_009661	TTG	2	6	35595	35600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_009661	GCC	2	6	35729	35734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
172	NC_009661	CGG	2	6	35784	35789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_009661	TGA	2	6	35850	35855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009661	TCGG	2	8	35871	35878	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
176	NC_009661	TCGCT	2	10	35884	35893	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_009661	CAT	2	6	37302	37307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_009661	TGA	3	9	38430	38438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_009661	TTG	2	6	38462	38467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_009661	G	6	6	38505	38510	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
186	NC_009661	GCG	2	6	38811	38816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_009661	GCC	2	6	38822	38827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_009661	CGG	2	6	38877	38882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_009661	GCT	2	6	38911	38916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
190	NC_009661	TGA	2	6	38943	38948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009661	TCGCT	2	10	38977	38986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
192	NC_009661	GCAA	2	8	39013	39020	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_009661	ACC	2	6	39064	39069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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195	NC_009661	CAC	2	6	39192	39197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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198	NC_009661	GCGA	2	8	39255	39262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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283	NC_009661	AT	4	8	75214	75221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_009661	TGTT	2	8	75228	75235	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009661	AAT	2	6	75307	75312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009661	CTT	2	6	75421	75426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_009661	AC	3	6	83202	83207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.